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jueves, 8 de octubre de 2015

Glifosato Roundup Toxicidad crónica en Hígado y Riñón a dosis ultra bajas

Análisis del perfil del transcriptoma refleja hígado de rata y daño renal después de ultra baja dosis de exposición crónica Roundup

Robin Mesnage 1, Mateo Arno 2, Manuela Costanzo 3, Manuela Malatesta 3, Gilles-Eric Séralini 4 y Michael Antoniou N. 1 *
1Expresión Génica y Terapia de grupo de la Facultad de Ciencias de la Vida y Medicina, Departamento de Genética Médica y Molecular, del Kings College de Londres, octavo piso de la torre del ala, Hospital Guy, Great Maze Pond, Londres SE1 9RT, Reino Unido
2Genómica Centre, del Kings College de Londres, Waterloo Campus, 150 Stamford Street, Londres SE1 9NH, Reino Unido
Departamento de Ciencias Neurológicas y del Movimiento de la Universidad de Verona, Verona 37134, Italia3
4Instituto de Biología, EA 2608 y Polo Riesgo, MRSH-CNRS, Explanada de la Paix, de la Universidad de Caen, Caen 14032, Cedex, Francia

Salud Ambiental 2015, 14: 70 doi: 10.1186 / s12940-015-0056-1

Recibido:21 de abril 2015Aceptado:11 de agosto 2015Fecha de publicación:25 de agosto 2015

Heatmaps de las tres principales funciones biológicas ontológicamente enriquecidos desde el análisis del transcriptoma del hígado y los riñones. Las funciones biológicas ontológicamente enriquecido (Tabla 2) derivada de la alteración en los patrones de expresión de genes comúnmente perturbado en hígado y riñones de ratas hembra tratadas Roundup (Figs. 2 y 3) con respecto con respecto al mRNA de empalme a través de spliceosome (GO: 0000398, en azul), modificación de las histonas (GO: 0016570, en amarillo) y la respiración celular y el ciclo TCA (GO: 0045333 y GO: 0006099, en rosa), se agruparon en heatmaps órgano-específicas utilizando la agrupación jerárquica de las muestras (C, control; R, Roundup) y variables (símbolos de genes). Una clara separación basado en la dirección (hacia arriba o baja regulación) de la expresión génica, la función biológica y órganos entre Roundup tratados y animales de control es discernible

Fondo


Herbicidas a base de glifosato (GBH) son los principales plaguicidas utilizados en todo el mundo. Evidencias convergentes sugieren que GBH, como Roundup, representan un riesgo de salud en particular al hígado y los riñones, aunque no se han examinado las dosis bajas de relevancia ambiental. Para solucionar este problema, (/ / dar una ingesta diaria de 4 ng kg pc días del glifosato) se llevó a cabo un estudio de 2 años en ratas administrando 0,1 ppb Roundup (50 ng / L de glifosato equivalente) a través del agua potable. Un marcado aumento de la incidencia de los cambios bioquímicos anatomorphological y sangre / orina era indicativo de hígado y estructura de los riñones y la patología funcional. Con el fin de confirmar estos hallazgos que hemos llevado a cabo un análisis de microarrays transcriptoma del hígado y riñones de estos mismos animales.

Resultados


La expresión de 4224 y 4447 transcripción grupos (un grupo de sondas correspondientes a un gen conocido o putativo) se encontraron para ser alterado respectivamente en hígado y riñón (p <0 span=""> q <0 span=""> Los cambios en la expresión génica variaban de -3,5 a 3,7 veces en el hígado y desde -4.3 a 5,3 en los riñones. Entre los grupos de transcripción 1319 cuya expresión se vio alterada en ambos tejidos, se encontraron enriquecimiento ontológica en 3 categorías funcionales entre 868 genes. En primer lugar, los genes implicados en mRNA de empalme y pequeños ARN nucleolar eran en su mayoría upregulated, lo que sugiere la interrupción de la actividad normal spliceosome. Electron análisis microscópico de los hepatocitos confirmó nucleolar alteración estructural. En segundo lugar, los genes que controlan la estructura de la cromatina (N-metiltransferasas especialmente histona-lisina) fueron principalmente upregulated. Tercero, los genes relacionados con la compleja cadena respiratoria I y el ciclo del ácido tricarboxílico eran en su mayoría downregulated. Pathway análisis sugiere una modulación de las vías de señalización de mTOR y fosfatidilinositol. Perturbaciones gen asociado con la administración crónica de ultra-baja dosis Roundup reflejan una condición hígado y el riñón lipotoxic y el aumento de crecimiento celular que puede estar vinculado con la regeneración en respuesta a los efectos tóxicos que causan daño a los tejidos. Alteraciones observadas en la expresión génica fueron consistentes con la fibrosis, necrosis, fosfolipidosis, disfunción de la membrana mitocondrial y la isquemia, que se correlaciona con y así confirmar las observaciones de la patología plantearse en las anatómico, histológico y nivel bioquímico.

Conclusión

Nuestros resultados sugieren que la exposición crónica a un GBH (herbicidas basados ​​en glifosato) en un sistema modelo de toxicidad en animales de laboratorio establecido en una dosis ultra baja, ambiental puede dar lugar a daños en el hígado y el riñón con potenciales implicaciones importantes para la salud de las poblaciones animales y humanas.

Palabras clave: 
Los pesticidas; El glifosato; Transcriptome; Toxicidad crónica; Hígado; Riñón

Herbicidas a base de glifosato (GBH), como el Roundup, son los principales plaguicidas utilizados en todo el mundo. GBH se aplican actualmente en al menos el 24% de las tierras de cultivo total mundial (Benbrook C, comunicación personal), y también se utiliza ampliamente en los ambientes domésticos y urbanos. Residuos de GBH se detectan de forma rutinaria en los productos alimenticios [1], [2] y también el agua contaminada a través de la lluvia, la escorrentía superficial potable y lixiviación en las aguas subterráneas, lo que aumenta las posibles vías de exposición [3]. Los datos epidemiológicos sobre la carga corporal humana de los residuos de GBH es muy limitado, pero la evidencia sugiere que el glifosato y sus metabolitos son muy extendida [4].
Percibida modo primario de glifosato de acción herbicida es inhibir la sintasa de 5-enolpiruvilsiquimato-3-fosfato (EPSPS) de la ruta de biosíntesis de shikimato aromático presente en las plantas y algunas bacterias de ácido amino. Desde esta vía está ausente en los vertebrados, se asume generalmente que el glifosato plantea riesgos para la salud mínimos en mamíferos, incluyendo humanos [5]. Sin embargo, la evidencia sugiere que la convergencia de los residuos GBH plantean un riesgo particular para la función renal y hepática. Efectos hepáticos de glifosato se observaron por primera vez en la década de 1980, incluyendo su capacidad de alterar el hígado fosforilación oxidativa mitocondrial [6]. Como glifosato puede actuar como un protonóforo aumento de la permeabilidad de la membrana mitocondrial a los protones y Ca 2+ [7], que puede desencadenar la producción de especies reactivas de oxígeno dando como resultado el estrés oxidativo observado [8].Elevación de los marcadores de estrés oxidativo se detecta en el hígado y el riñón de ratas después de la exposición subcrónica a GBH en los Estados Unidos permitió la concentración de glifosato de 700 μg / L en el agua potable [9]. Cambios y alteraciones de la bioquímica clínica histológicos hepáticos son detectados en ratas que consumen 4,87 mg / kg de peso corporal (pc) glifosato cada 2 días más de 75 días [10].
Estudios metabólicos en una variedad de animales de laboratorio y de granja muestran niveles de glifosato y ácido aminometilfosfónico (AMPA, el producto de degradación principal de glifosato) en los tejidos de riñón e hígado que son de 10 a 100 veces o incluso mayor que los niveles encontrados en grasa, muscular, y la mayoría de otros tejidos [11]. En los animales de granja, los niveles urinarios de glifosato elevados se correlacionan con alteraciones en los parámetros séricos sangre indicativos de estrés oxidativo hepático y renal y disminución en los niveles de elementos traza de nutrientes[12].
Además de estos efectos citotóxicos, los estudios han sugerido que GBH puede interrumpir varios sistemas endocrinos de señalización, incluyendo el estrógeno [13] y ácido retinoico [14]. Endocrinos efectos perturbadores pueden explicar el deterioro del desarrollo reproductivo en ratas expuestas a dosis subletales de GBH [15]. Efectos en las vías de señalización del ácido retinoico se han propuesto para explicar los posibles efectos teratogénicos de GBH en mamíferos [16] y anfibios [14].
No obstante, debe tenerse en cuenta que la mayoría de los resultados de estos estudios de toxicidad GBH se obtuvieron a dosis mucho mayores que la exposición general de la población humana. Las dosis probadas fueron típicamente sobre la ingesta diaria admisible glifosato (ADI), que actualmente es de 0,3 mg / kg de peso corporal / día en la Unión Europea y de 1,75 mg / kg de peso corporal / día en los EE.UU. sobre la base de mediciones de toxicidad hepatorrenal después de la exposición crónica en ratas, aunque la toxicidad GBH no se investigó en experimentos de larga duración.

Con el fin de abordar esta cuestión, se realizó un estudio de 2 años en los que se administra a ratas a través de agua potable a una concentración de 0.1 ppb Roundup, que contiene por lo tanto no sólo el glifosato sino también adyuvantes [17]. La concentración equivalente de glifosato fue de 0,05 μg / L y corresponde a una concentración admisible dentro de la Unión Europea (0,1 μg / L) y EE.UU. (700 μg / L). 
Los resultados mostraron que el Roundup provocó un aumento de la incidencia de signos anatómicos de patologías, así como cambios en la orina y parámetros bioquímicos sanguíneos sugestivos de hígado e insuficiencia renal funcional en ambos sexos. En un esfuerzo para confirmar estos hallazgos a través de un enfoque biológico molecular más cuantitativa y obtener una idea de las alteraciones en los perfiles de expresión de genes asociados con el aumento de los signos observados de patologías renales y anatomorphological hígado, se realizó un análisis transcriptómica completa de estos órganos de la cohorte hembra de animales. Se encontró un gran número de grupos de transcripción (> 4000) para ser alterado en su nivel de expresión tanto en el hígado y los riñones del grupo tratado con Roundup relación con los controles y con un muy alto significación estadística.Las alteraciones en perfiles de expresión génica son típicas de perturbaciones medidas en los casos de fibrosis, necrosis, fosfolipidosis, disfunción de la membrana mitocondrial y la isquemia. Por lo tanto, nuestros resultados confirman la dosis ultrabaja Roundup inducida por aumento de la incidencia de patologías hepatorrenal sugeridos por observaciones en una anatómico, histológico y nivel bioquímico.


Métodos

Diseño experimental

Los tejidos analizados en este estudio se obtuvieron de los animales como se describió anteriormente[17]. Brevemente, el protocolo experimental fue el siguiente. Tras 20 días de aclimatación, 5 semanas de edad ratas Harlan Sprague-Dawley fueron asignados al azar sobre una base de peso en grupos de 10 animales. Los animales fueron alimentados con la dieta estándar A04 (Safe, Francia), incluyendo 33% DKC maíz 2675 más de 2 años. Todas las formulaciones de piensos consistía en una dieta equilibrada, miden químicamente como sustancialmente equivalente. Todos los animales se mantuvieron en jaulas de policarbonato (820 cm 2, Genestil, Francia). Se cambió periódicamente la ubicación de cada jaula dentro de la sala experimental. La camada (clásico toplit, Caja fuerte, Francia) fue sustituido dos veces por semana. Los animales se mantuvieron a 22 ± 3 ° C con una humedad controlada (45 a 65%) y la pureza del aire con un ciclo de 12 h luz / oscuridad, con acceso libre a comida y agua. Todos los reactivos utilizados fueron de grado analítico. El protocolo experimental de los animales se realizó de conformidad con el reglamento de la comisión de ética locales en una unidad de cuidado de los animales autorizada por los ministerios franceses de Agricultura y la Investigación (Número de Contrato A35-288-1). Los experimentos con animales se realizaron de acuerdo a los lineamientos éticos de la experimentación animal (Reglamento CEE 86/609).
Los grupos de 10 animales tuvieron acceso ni agua corriente (control) o con la misma agua suplementada con 1.1E-8% de Roundup (0,1 ppb o 50 ng / L de glifosato dilución equivalente). La formulación comercial de Roundup utilizado fue de Grand Travaux Plus (450 g / L de glifosato, aprobación 2.020.448; Monsanto, Bélgica). El nivel requerido de dilución Roundup en el agua potable se confirmó mediante medición de la concentración de glifosato por HPLC-MS / MS. Del mismo modo, se estudió la estabilidad de glifosato en solución y validado durante el período de 7 días entre dos preparaciones de la prueba, las soluciones de tratamiento. El glifosato y AMPA no se encontraron en la alimentación en el límite de detección de 5 mg / kg
.

Análisis de toxicidad

Monitoreo dos veces por semana permitió la observación cuidadosa y la palpación de los animales, registro de los signos clínicos, la identificación y medición de cualquier tumores, la alimentación y el consumo de agua, y el peso corporal individual. Medición de las tasas de mortalidad, anatomía patológica (en 34 órganos diferentes), bioquímica sérica (31 parámetros) y composición de la orina (11 parámetros) se han descrito ampliamente [17].
Por microscopía electrónica de transmisión, fragmentos de hígado se fijaron en pre-refrigerados 2% de paraformaldehído / 2,5% de glutaraldehído en 0,1 M tampón fosfato salino pH 7,4 a 4 ° C durante 3 h y se procesaron como se describió previamente [18]. Evaluación de la célula, citoplasma y el área nuclear, y la relación nuclear-citoplasmática se determinó a partir de mediciones en 30 hepatocitos por animal. Parámetros nucleares celulares (% heterocromatina, densidad de poro, área de centros fibrilares, centros fibrilares%,% componentes fibrilares densos y% de componentes granulares) se midieron en 10 núcleos por animal.


El muestreo de tejidos y la extracción de RNA

Los animales fueron sacrificados a la misma hora del día durante el curso del estudio ya sea para cumplir con las regulaciones de bienestar animal para evitar sufrimientos innecesarios (por ejemplo, resultante de la pérdida de peso corporal 25%, la presencia de tumores más del 25% de peso corporal, sangrado hemorrágico, o postración) o en la terminación del período de estudio de 2 años.Los animales fueron sacrificados por desangrado bajo anestesia con isoflurano. El hígado se dividió en dos porciones; uno fue broche de congelados en nitrógeno / hielo seco líquido y almacenados a -80 ° C. Un riñón también se congeló rápidamente. (Nota: debido al manejo de errores en la compañía empleada para llevar a cabo el experimento, una muestra de riñón del grupo de tratamiento Roundup no estaba disponible para análisis).
Rebanadas de sección transversal transversales de hígado y los riñones fueron procesados ​​para extracción de ARN total usando MagMax-96 para el kit de aislamiento de ARN total Microarrays (Ambion, Life Technologies Ltd, Paisley, Reino Unido).

La hibridación de microarrays

El ARN total (500 ng) se marcó usando desoxinucleotidil transferasa terminal (TdT) en presencia de un compuesto biotinilado de propiedad utilizando el kit de transcripción de expresión toda Ambion y toda la transcripción kit Terminal Etiquetado (Affymetrix UK Ltd., High Wycombe, Reino Unido), siguiendo protocolos estándar. Empleamos Array ST Affymetrix GeneChip® Rata Gen 2.0 que contiene aproximadamente 610.400 sondas agrupadas en 214.300 a nivel exón y 26.400 conjuntos de la sonda de nivel de genes. La mediana del número de sondas por transcripción es 22, por lo general distribuidos a lo largo de toda la secuencia de transcripción. En general, este microarray cubre 28,407 transcripciones RefSeq incluyendo transcripciones de codificación de proteínas 16.771 mil. En comparación, la versión 5.0 de la anotación de la rata (cepa BN / SsNHsdMCW) montaje del genoma contiene 30.404 transcripciones incluyendo 22.777 genes que codifican. El análisis se realizó en el nivel de transcripción grupos. También utilizamos la suite analítica MetaCore para realizar el factor de transcripción y el análisis de procesos de vía y la toxicidad basado en objetos de red reconocidos por MetaCore.
Cócteles de hibridación se aplicaron a Affymetrix rata Gene 2.0 microarrays y procesados ​​de acuerdo con el procedimiento recomendado por el fabricante mediante el sistema de microarrays GCS3000 (Affymetrix). Matriz de datos se exportan como intensidad celular (CEL) archivos para su posterior análisis.


Análisis de datos de microarrays

CEL archivos se normalizaron juntos en la Expresión paquete de software de la consola (Affymetrix), utilizando la gama Multi-media (RMA) algoritmo boceto robusto (a nivel de genes). Los datos de control de calidad fue evaluada mediante el uso de indicadores y directrices estándar para el sistema de microarrays de Affymetrix. Archivos de datos normalizados (archivos CHP) se importaron en ómicas Explorer 3.0 (Qlucore) para su posterior control de calidad y análisis estadístico. Se decidió incluir todos los genes en las pruebas ya que no hay medida simple de la presencia / ausencia de RMA normalizado de datos de Rata Gen 2,0 arrays ST. A pesar de que se arriesga a una tasa de falso descubrimiento superior, todos los datos recogidos fueron sometidos a las pruebas estadísticas para no filtrar inadvertidamente genes importantes en base a un umbral de detección arbitraria. Los datos utilizados para el análisis funcional se seleccionaron a los valores de corte de p <0 con="" el="" fc=""> 1.1 utilizar grandes listas de genes como se recomienda [19]. Los-valores q, una estimación de la tasa de falso descubrimiento, fueron los p-valores corregidos mediante el procedimiento Benjamini-Hochberg y estaban por debajo del 8%.
Gene ontología, vías, redes de genes, de unión al factor de transcripción y la ontología de la enfermedad se analizó mediante el Reuters MetaCore suite analítica Thomson reconocer objetos de red (proteínas, complejos de proteínas o grupos, péptidos, especies de ARN, compuestos entre otros) y / o en la base de datos del NIH para Anotación, Visualización y Integrados Descubrimiento Bioinformática Recursos 6.7, reconociendo los genes que codifican individuales, utilizando recomienda parámetros analíticos [19]. Estos datos de microarrays se han presentado a genes de Omnibus y son accesibles a través de número de acceso GSE66060.

La validación de datos de microarrays por tiempo real qPCR

Con el fin de validar la lista de expresados ​​diferencialmente / genes regulados revelados por el análisis de microarrays, se seleccionaron al azar un subconjunto de 18 genes para el análisis por PCR en tiempo real cuantitativa (RT-qPCR) usando las muestras de ARN originales como material de partida. El ARN total (2 μg) se convirtió en ADNc con la alta capacidad kit RNA-to-cDNA (Applied Biosystems, Life Technologies Ltd, Paisley, Reino Unido), y mediciones de la expresión de genes se evaluó mediante RT-qPCR usando ensayos de expresión génica TaqMan y TaqMan PCR Universal Master Mix (Applied Biosystems). Housekeeping genes utilizados como controles endógenos eran de dos tipos: 1) los genes de limpieza utilizados históricamente de tres estándares (Gapdh, HPRT1, Actb)(de la lista GeNorm) como uno de los grupos de transcripción más invariantes de microarrays de datos; es decir, los genes con la desviación estándar más bajo en todas las muestras pertinentes, y con el nivel alto o comparable expresión, y 2) Pes1, un gen que no está sexo y / o multi-regulados por hormonas en estudios en ratas [20]. Métodos Delta Ct se usaron para normalizar la expresión de los genes seleccionados de interés frente a la media de los genes de control endógeno. Grupo pliegue cambios log ratio (relación con los grupos de control) se calcularon utilizando el método de RQ en el software v3.0 DataAssist (Applied Biosystems).


Resultados

La selección de tejidos

Los tejidos de hígado de rata y de los riñones que formaban el material de partida para esta investigación se obtuvieron de animales que formaban parte de un (2 años) estudio de toxicidad crónica mirando los efectos del Roundup plaguicidas [17]. Roundup se administró a través del agua a ratas Sprague-Dawley a beber a una dosis regulatorio admisible (50 ng / L de glifosato dilución equivalente) y que es representativo de lo que se puede encontrar en el agua del grifo contaminada.A esta dosis, el glifosato equivalente ingesta diaria promedio de Roundup fue de aproximadamente 4 ng / kg de peso corporal / día del glifosato.
Los machos sufrieron daño hepático y renal con más intensidad que en las mujeres, lo que resulta en una mayor tasa de muerte prematura [17]. La mayoría de las ratas macho fueron descubiertos después de que ocurrió la muerte. Esto dio lugar a la necrosis del órgano que los hace inadecuados para su posterior análisis y por lo tanto fueron excluidos de perfiles transcriptoma. Por lo tanto, centramos nuestra investigación en las hembras que se disponía de los tejidos recién disecados de cohortes de 9-10 ratas sacrificados tratadas y no tratadas.
Control de la hembra y los animales tratados con Roundup fueron sacrificados, respectivamente, a 701 +/- 62 y 635 +/- 131 días (archivo adicional 1). El análisis anatomopatológico de los órganos de estos animales reveló que el hígado y los riñones son los órganos más afectados [17]. Ratas hembra tratadas con Roundup mostraron signos 3 veces anatómicas de la patología (15 en 8 ratas) que el grupo control (6 ratas en 4). Además, suero y orina análisis bioquímicos mostraron un aumento de los niveles de triglicéridos en suero. Si bien no se detectó daño renal severa anatómica, análisis bioquímico reveló una disminución en los niveles de Na, Cl, P y K de sangre y un aumento correspondiente en la orina sugiere la fuga de iones y la disminución de la creatinina urinaria.Tomados en conjunto estas alteraciones en la sangre y los parámetros bioquímicos urinarios sugieren un deterioro de la función renal. En general, el doble del número de parámetros bioquímicos fue perturbado en el riñón que lo que se puede esperar por azar. Además, un desequilibrio de testosterona / estrógeno era evidente con los niveles séricos de testosterona aumentó significativamente en un 97% en comparación con los controles, mientras que los niveles séricos de estradiol se redujeron en un 26%. Estas observaciones, junto con alteraciones de la glándula pituitaria sugieren efectos de alteración endocrina.
Electron análisis microscópico de secciones de hígado de estos animales mostraron interrupción nucleolar en los hepatocitos (Fig. 1). Hubo un aumento estadísticamente significativo de la célula y el área citoplasmática. No se observaron daños estructurales importantes celular. Sin embargo, el análisis de morfometría nuclear mostró que los hepatocitos de ratas hembra tratadas con Roundup tenían un contenido estadísticamente significativa mayor heterocromatina, un componente fibrilar denso reducida y un aumento concomitante en el componente granular en comparación con los controles que indican una alteración de la función nucleolar y en general disminución del nivel de la transcripción (Fig. 1a). Además, una dispersión citoplásmica de glucógeno también se observó en el grupo tratado Roundup (Fig. 1b).
miniaturaFig. 1. Las alteraciones en la arquitectura nuclear de hepatocitos en ratas tratadas con Roundup femeninos sugiere alteraciones transcripcionales.Hepáticas de control (C) y Roundup (R) tratados ratas hembra se sometieron a un análisis microscópico de electrones ultraestructural para investigar la arquitectura subcelular. Una cuantificación de análisis morfométrico de los hepatocitos que revelan alteraciones en subnuclear (heterocromatina, fibrilar denso, granular) compartimentos indicativo de una reducida estado transcripcional. Los parámetros morfométricos están representados por su media y su desviación estándar. Unaprueba t no pareada de dos colas fue utilizado como prueba estándar para las comparaciones estadísticas (*** p <0 span=""> B micrografías electrónicas representativas que comparan los hepatocitos de control (panel superior) y (panel inferior) ratas tratadas con Roundup que muestran una interrupción de la dispersión de glucógeno (G). N núcleo, r retículo endoplasmático rugoso

Patrones Transcriptome segregan muestras de hígado y riñón basado en el tratamiento Roundup

En un intento de confirmar los efectos anatomopatológicos de una manera más cuantitativa y para comprender mejor los perfiles de expresión de genes que están asociados con los signos de la patología observada en el hígado y los riñones, se realizó un completo análisis de microarrays transcriptoma de estos órganos. Empezamos por llevar a cabo una supervisión Análisis de Componentes Principales (PCA) del conjunto de datos, lo que reduce un perfil de alta dimensión de expresión a las variables individuales (componentes) de retención mayor parte de la variación (Fig.2a). Como control y los animales tratados con Roundup fueron sacrificados a diferentes edades, que inicialmente se realizó un análisis de PCA donde los animales individuales fueron ordenadas por edad (más antiguo vs más joven), para determinar si las diferencias en los perfiles de transcriptoma correlacionan con este parámetro (archivo adicional 2). Esto demostró que los valores de control estadísticos fueron débiles, sin segregación de los animales más viejos y más jóvenes en el control o grupos tratados con Roundup, lo que indica que la edad no era una fuente importante de diferencia.Por el contrario, se observó una separación clara entre el control y las ratas tratadas con Roundup sobre la base de tratamiento (Fig. 2a; Archivos adicionales 3 y 4). Incluso si los principales componentes sólo representan ~ 30% de la variación observada, lo que parece bastante bajo, esta visión de alto nivel de los datos mostró una segregación homogénea y una baja variabilidad intragrupo, así como la ausencia de valores atípicos. Cifra 2b muestra la significación estadística (por pruebas t de Student) de la expresión diferencial de clúster transcripción por parcelas volcán junto con los respectivos cambios veces (FC) (Fig. 2b), donde un grupo transcripción constituye un grupo de clusters exón (exón cada grupo compuesto por diferentes sondas) que corresponde a un gen conocido o putativo. En general, los cambios de expresión génica variaron -3,5 a 3,7 veces en el hígado y -4,3 a 5,3 en los riñones. La expresión de 57 y 226 grupos de transcripción nos molestó, respectivamente, en hígado y el riñón a través de una FC de 2. AKR1B1 (FC de - 4,3, p = 2.2e - 5) y Ten1 (FC de - 3,5, p = 7.3E - 4) fueron los genes más regulados abajo, respectivamente, en el hígado y los riñones Las transcripciones mayoría hasta reguladas eran pequeños RNAs nucleolar (snoRNAs), ENSRNOT00000053015 en el hígado (FC = 3,7; p = 3.0E-6) y ENSRNOT00000068958en los riñones (FC = 5,3, p = 8.6E-7). Se observó significación estadística Grande (p-valores hasta 2.3E-10 en el hígado). Un gran número de grupos de transcripción se altera significativamente por debajo de los umbrales estrictas q-valor (tabla 1). Además, el análisis estadístico de muestras aleatorias simuladas confirma que el grado de diferencia estadística entre los grupos control y de tratamiento Roundup son mucho mayores que lo que se puede esperar por azar (Tabla 1).
miniaturaFig. 2. Amplia escala perfil transcriptoma alteración en el hígado y los riñones de las ratas hembras tratadas con Roundup. Hígado y los riñones de las ratas y los animales de control reciben 0,1 ppb Roundup (50 ng / L glifosato dilución equivalente) en el agua potable se sometieron a un análisis completo de microarrays transcriptoma. Un análisis PCA de los perfiles de expresión de clúster transcripción muestra una clara separación en grupos de tratado ( rojo) y control (verde) ratas en ambas muestras de riñón e hígado.Números de puntos de datos denotan la edad al momento de la muerte en el día. Parcelas bVolcán de los perfiles de hígado y riñón transcriptoma que muestran los log 2 veces los cambios y las -log10 p-valores en la expresión grupo transcripción inducida por la exposición Roundup en comparación con los controles. Los datos fueron seleccionados en los valores de corte de p<0 cambio="" doble="" y=""> 1.1. Los puntos rojos representan genes comúnmente perturbado entre las muestras de hígado y riñón
Tabla 1. Número de grupos de transcripción cuya expresión se altera en diferentes umbrales de corte valores de p
Los datos utilizados en el análisis funcional se seleccionaron a los valores de corte de p <0 span="" y=""> q<0 con="" el="" fc=""> 1.1 para su uso con grandes listas de genes como se recomienda previamente[19]. Un diagrama de Venn comparando los perfiles de expresión de clúster de hígado y riñón de transcripción en un FC> 1.1 (Fig. 3a) indica que aunque la mayoría de los disturbios eran tejido específico, 1319 transcripción grupos fueron perturbados comúnmente entre los dos órganos. Una comparación en una corte umbral seleccionado frecuencia del FC> 2 resultados de nuevo con la mayoría de los cambios en la expresión génica ser específico a cualquiera de hígado o riñón, pero con un total de 20 genes se altera comúnmente en ambos órganos (Fig. 3b). El FC, p-valor y q-valor para todos los genes cuya expresión se altera comúnmente en el hígado y el riñón se muestran en archivo adicional 5.
miniaturaFig. 3. amplio espectro de expresión grupo transcripción es perturbado comúnmente en el hígado y el riñón por Roundup. Diagramas de Venn número de genes alterados comúnmente en el hígado y los riñones mostrando como lo revela el análisis del transcriptoma en corte de los valores de umbral de p <0 cambio="" doble="" y=""> 1.1 (a) y> 2 (b)
De estos, 18 genes fueron seleccionados al azar para la validación de los resultados de microarrays por RT-qPCR (archivo adicional 6). El patrón general de los resultados de RT-qPCR confirmó los datos de microarrays con el 86% de los genes que se encuentran para ser similar altura o hacia abajo-regulada por ambos métodos.


La función de genes implicados en las alteraciones de la respiración mitocondrial, la función spliceosome y modificación estructura de la cromatina se asocia con el tratamiento Roundup

A continuación realizamos un análisis ontología de los 1319 grupos de transcripción comúnmente desregulados en el hígado y el riñón con la función de clasificación funcional de genes DAVID para revelar los más afectados categorías de genes. Como resultado fueron reconocidos 868 genes. Los 8 grupos de perturbaciones funcionales que tienen puntuaciones de enriquecimiento más de 2 se presentan en la Tabla 2. Todo tiene p-valores significativos y Benjamini corrigió valor p (q-valores).Se identificaron un total de 3 principales redes de genes afectados.
Tabla 2. agrupación funcional de genes derivados utilizando el gen herramienta de clasificación funcional DAVID
En primer lugar, dos grupos estaban relacionados con la función spliceosome. Esto incluye genes que codifican escisión y poliadenilación factores específicos (Cpsf2, CPSF3 y Cpsf7), ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas (Hnrnpl, Hnrnpf) y factores de empalme (Sf3b5, Sf3a1). La expresión de todos estos genes se upregulated con la excepción de CPSF3. Otros genes implicados en el empalme de ARN, tales como Luc7l3, Pnn, Prpf4b, Pnisr, Prpf39, Srek1, Ddx39b y Ddx39a, se upregulated significativamente. Además, la expresión de al menos 160 snoRNAs no codificantes se encontraron para ser alterado con casi todos se upregulated con una gran FC de hasta 5,32 para los riñones ENSRNOT00000068958in. En segundo lugar, dos grupos consistían en miembros de la familia modificación de la cromatina de las enzimas, en particular, N-metiltransferasas de histona-lisina.Expresión de los 7 genes (MEN1, Setdb1, Suv420h2, Dot1l, Ehmt1, Ehmt2, NSD1) que pertenecen a este grupo se reguló. Otros genes con una ontología relacionada (mLL2, Mll4, Tet3, Baz2a, Dnmt3a, Brd1, Brd4, Ino80d o Arid4b), que no se tienen en cuenta en el conjunto de las funciones biológicas enriquecidas, también se upregulated. La mayoría también pertenecen a la familia de los complejos de N-metiltransferasa de histona-lisina que los residuos de lisina específicamente metilato de la histona H3 (Lys-4, 9, 20 o 79) o H4 (Lys-20), entre otros, el etiquetado de ellos por condensación de la cromatina. Además, la mayoría de ellas también se incluyen en un clúster perturbada mayor de 40 genes implicados en la regulación negativa de los procesos de biosíntesis de macromoléculas.
En tercer lugar perturbación, funcional de genes implicados en el metabolismo mitocondrial fue representado por dos clusters, especialmente relacionados con la cadena respiratoria complejo I y el ciclo TCA. La expresión de la mayoría de estos genes fue reprimida. Un total de 7 genes que codifican NADH deshidrogenasa (ubiquinona) complejo I de la cadena respiratoria mitocondrial se encontró perturbado, con 6 de ellos se downregulated. Además, se downregulated los genes que codifican deshidrogenasas isocitrate (Idh3B y Idh3g), succinato deshidrogenasa (SDHC), ligasas-succinato CoA(Sucla2 y Suclg2) y sintasas ATP complejos F1 mitocondrial (Atp5b y Atp5d). Estos datos sugieren que las actividades de los complejos mitocondriales, en particular, la actividad respiratoria, están deprimidos.
Estos 3 principales funciones biológicas enriquecidas son presentados por los mapas de calor órgano-específicas utilizando la agrupación jerárquica de las muestras (Fig. 4). Nuestros resultados muestran genes relacionados con la respiración mitocondrial y el ciclo TCA son reprimidos en su mayoría, mientras que los que participan en mRNA de empalme y la modificación de las histonas son upregulated.
miniaturaFig. 4. Heatmaps de las tres principales funciones biológicas ontológicamente enriquecidos desde el análisis del transcriptoma del hígado y los riñones. Las funciones biológicas ontológicamente enriquecido (Tabla2) derivada de la alteración en los patrones de expresión de genes comúnmente perturbado en hígado y riñones de ratas hembra tratadas Roundup (Figs. 2 y 3) con respecto con respecto al mRNA de empalme a través de spliceosome (GO: 0000398, en azul), modificación de las histonas (GO: 0016570, en amarillo) y la respiración celular y el ciclo TCA (GO: 0045333 y GO: 0006099, en rosa), se agruparon en heatmaps órgano-específicas utilizando la agrupación jerárquica de las muestras (C, control; R, Roundup) y variables (símbolos de genes). Una clara separación basado en la dirección (hacia arriba o baja regulación) de la expresión génica, la función biológica y órganos entre Roundup tratados y animales de control es discernible


Cambios Roundup asociadas pueden ocurrir a través de las vías de señalización de hormonas sexuales

El análisis de ontología de genes (Tabla 2) indica una modulación de vías de señalización celular ha tenido lugar. Los procesos biológicos GO GO: 0007264 "pequeña señal GTPasa mediada transducción" (21 genes, p = 1.2E-3, q = 1.2E-1) y GO: 0007242 "cascada de señalización intracelular" (57 genes, p = 2.2E- 3, q = 1.7E-1) se enriquecen entre los genes comúnmente perturbado en el hígado y los riñones. Además, las redes de relieve por este análisis que puede dar cuenta de la alteración en la expresión génica se centraron en los factores de transcripción Creb1 (280 genes regulados, p ~ 0), c-Myc (159 genes regulados, p ~ 0), YY1 (113 genes regulados, p<4 .8e-234="" 4="" class="apple-converted-space" genes="" oct3="" regulados="" span=""> p <6 .7e-194="" class="apple-converted-space" esr1="" genes="" regulados="" span="" y=""> p <8 .e-171="" adicional="" archivo="" span=""> 7). Estos factores de transcripción están íntimamente relacionados en la regulación de la expresión génica y pueden estar involucrados en las vías de señalización de la hormona.
En este contexto, cabe destacar que el gen que codifica el receptor de andrógenos es estadísticamente significativamente downregulated en el hígado (FC = -1,4, p = 8.1e-3, q = 7.7E-2) y los riñones (FC = -1,32, p = 2.9E-3, q = 3.8E-2). Además, el gen beta del receptor de retinoide X(RXRB) está regulada positivamente de manera significativa en el hígado (FC = 1,2, p = 3.5E-5, q = 3.2E-3) y los riñones (FC = 1,36, q = 4.5E-6, q = 1.2E-3). Además, la anotación KEGG para la vía de señalización mTOR (14 genes, p = 6.4E-3, q = 0,21) y el sistema de señalización fosfatidilinositol (16 genes, p = 1.3E-2, q = 0,29) se enriquecen en el hígado . En el riñón, la anotación KEGG para la vía de señalización adipocytokine (que implica mTOR) (19 genes, p = 2.4e-3, q = 0,06) y el sistema de señalización fosfatidilinositol (21 genes, p = 6E-4, q = 0,05) son enriquecido. Sin embargo, la expresión de la estrella, que ha sido sugerida por estudios previos para mediar endocrino efectos de Roundup en las células tumorales de Leydig MA-10 interrumpiendo[21], y deESR1, ESR2 y aromatasa (CYP19A1), que fueron encontrados perturbado en la línea celular de hepatocitos HepG2 humana[22], no se han encontrado para ser dysregulated en esta investigación.


Las alteraciones en el perfil del transcriptoma sugieren hígado y el riñón anatomorphopathogy

Puntaje mapas de rutas y procesos de toxicidad (Fig. 5) indica que múltiples funciones celulares podrían estar involucrados. De los grupos de transcripción 4224 hepáticas y renales 4447 se encuentran para ser alterado, 2636 y 2933, respectivamente, fueron objetos de red reconocidos por GeneGo MetaCore. Vías asignadas relacionadas con respuestas inflamatorias, que pueden ser los resultados secundarios a daño de órganos, se enriquecen (por ejemplo, los que implican NF-kappa B o la señalización de CD28). Varias vías asociadas con el citoesqueleto también se enriquecen, sugerente de un cambio en el crecimiento celular en un esfuerzo por superar los efectos tóxicos y para regenerar los tejidos dañados. En este sentido, el enriquecimiento de la proinsulina péptido C vía de señalización en el hígado (14 genes, p = 2.4e-5, q = 1.2E-3) la participación de mTOR y la fosfatidilinositol sistemas de señalización es de destacar ya que tiene un papel establecido en la proliferación celular y el metabolismo de los lípidos. Otros mapas confirmaron la inducción de vías de señalización intracelular y una influencia en el equilibrio entre la proliferación y la apoptosis. La regulación de la traducción por la actividad eIF4F (16 genes, p = 1.2E-6, q = 8.1e-5), otra función mTOR regulada, también está perturbado.
miniaturaFig. 5. Toxicidad análisis de ontología de genes alterados en el hígado y los riñones de las ratas tratadas con Roundup. Lista de los mejores de la vía y de proceso toxicidad redes 10 de puntuación revelados por el análisis de los perfiles de MetaCore hígado y riñón transcriptoma femeninos recibir 0.1 ppb de Roundup en el agua potable (p <0 .01="" cambios="" doble=""> 1,1). Los p-valores se determinan por cálculo hiper geométrica
Además, el GO "proceso metabólico" y "respuesta celular al estrés" procesos tienen bajos p-valores en el hígado (respectivamente p = 3.7E-58 y 3.9E-16) y los riñones (p = 1.5E-49 y 1.0E- 14), que sugieren fuertemente un estado de estrés metabólico. En general, el análisis de procesos toxicidad reveló alteraciones de expresión de genes asociados con la apoptosis, necrosis, fosfolipidosis, disfunción de la membrana mitocondrial y la isquemia. Así, la alteración en el perfil del transcriptoma identificado en este estudio se correlaciona con el aumento de los signos observados de la patología anatómica y funcional del hígado y los riñones.


Discusión

Presentamos aquí la primera en la investigación transcriptoma vivo en una especie de mamífero siguiente a largo plazo (2 años) la exposición a un GBH agrícola (Roundup) en una dosis relevante para el medio ambiente. Nuestros resultados confirman la mayor incidencia de patologías hepáticas y renales descritos en una anatomorphological y nivel bioquímico en sangre / orina en ratas hembras administrados con Roundup en el agua potable a un / concentración equivalente L glifosato regulatorio admisible, ultra baja dosis de 50 ng [17].Los niveles de consumo de glifosato fueron aproximadamente 4 ng / kg de peso corporal / día, que son muy por debajo de los valores de ADI globales. Se ha observado una gran escala, alteración asociada al tratamiento en patrones de expresión génica en una alta significación estadística tanto en el hígado y los riñones (Figs. 2 y 3;Mesa 1). Gene ontología análisis de estas alteraciones del transcriptoma está vinculado con un marcado cambio en la respiración mitocondrial, la actividad spliceosome, estructura de la cromatina y las vías de señalización de la hormona (Tabla 2). Colectivamente, las alteraciones en la expresión de genes (Fig. 4) están asociados con una desregulación de la homeostasis del tejido en el nivel de equilibrio de la proliferación de apoptosis (Fig. 5) y por lo tanto se correlaciona bien con el aumento de los signos de hígado y riñón anatómica, histológica y sangre / orina bioquímica patologías descritas en estos animales [17]. También hay que resaltar es que las alteraciones Roundup tratos asociados en los patrones de expresión de genes que observamos no corresponden a transcriptome firmas de necrosis hepática provocada por hepatotóxicas agudas [23].
Siguiendo el enfoque analítico recomendado para grandes conjuntos de genes [19], se observó un gran número (> 4000) cuya expresión se alteró tanto en el hígado y los riñones en el grupo de tratamiento Roundup (Fig. 3a). En la mayoría de los casos, el cambio en el nivel de la transcripción estaba por debajo de 2 veces (Fig. 3a y b) pero en un grado estadísticamente muy significativa (p<0 class="apple-converted-space" span=""> Estas observaciones implican que las bajas pero constantes cambios en la expresión de un gran número de genes pueden proporcionar suficiente resolución estadística ser informativo con respecto a cualquier patología órgano que pueda estar presente.
Sin embargo, dado el gran número de funciones de genes alterados tanto en el hígado y los riñones en el grupo de tratamiento Roundup, esto representa una combinación de efectos resultantes de la patología de estos órganos, así como un impacto directo del plaguicida. Así, no es posible a partir de nuestra investigación para distinguir definitivamente los efectos primarios de Roundup en el hígado y riñón transcriptoma de los efectos secundarios sobre la expresión de genes derivados de la patología presente en estos órganos. Sin embargo, la cohorte más pequeña de genes que se encuentran comúnmente perturbado en hígado y riñón (fig. 3; Archivo adicional 5) puede dar una idea de los sistemas que pueden ser los objetivos principales de este herbicida (Tabla 2).Nuestros resultados ponen de manifiesto la necesidad de futuros estudios de toxicidad GBH donde transcriptoma órgano se determina antes de la aparición de las patologías hepáticas y renales evidentes observadas en la terminación de la última etapa, como en este caso. Perturbaciones Así transcriptoma que en última instancia puede conducir a las patologías de órganos posteriores etapas se pueden identificar.Además, la relevancia clínica de nuestras observaciones Queda por examinar, en particular, ya que hay pocos datos disponibles sobre los niveles de glifosato en los seres humanos [4].
Los resultados de los estudios en los ratones fueron alimentados con dietas que contenían Roundup-tolerantes soja transgénica [18], [24] son consistentes con nuestras observaciones. Animales mostraron alteraciones en la arquitectura nuclear de hepatocitos, disminución de la expresión de ciertas enzimas respiratorias, una alteración de la actividad de empalme y marcado aumento de envejecimiento hígado. Además, observaciones similares se realizaron con hepatocitos de rata tratados con Roundup in vitro[25], lo que sugiere que las alteraciones en la función mitocondrial nucleolar y pueden ser un efecto primario directa de este herbicida.
Estudios previos, aunque las dosis mucho más altas, han demostrado que el glifosato puede desacoplar la fosforilación oxidativa mitocondrial de hígado [6] e inducir la permeabilización de la membrana no específico y un agotamiento de los índices respiratorios de succinato-dependiente en mitocondrias aisladas de ratas [26]. El modo de inhibición al glifosato de la EPSPS en plantas es por inhibición competitiva de la fosfoenolpiruvato (PEP) la unión del sustrato en el sitio activo de la enzima [5].Enzimas PEP unión son reguladores del metabolismo de la energía, en particular a través del ciclo de Krebs. El glifosato fuera de objetivo efectos pueden incluir la interrupción de estas enzimas. De hecho, el glifosato puede interactuar en el sitio de unión al sustrato y potencialmente inhibir la succinato deshidrogenasa mitocondrial [27]. Además, como pequeñas moléculas quelantes de zinc pueden perturbar el montaje spliceosome y la actividad de las enzimas de la cromatina modificación [28], el glifosato puede también han ejercido efectos directos sobre la función spliceosome debido a sus propiedades quelantes de metales (Patente No: US 3.160.632;[29]).
El aumento de la incidencia de patologías hepáticas y renales asociadas a Roundup [17] confirmó en este informe puede ser derivado de múltiples fuentes como cada vez hay más pruebas que sugieren que GBH y el glifosato puede producir efectos tóxicos a través de diferentes mecanismos, dependiendo del nivel de exposición. Sin embargo, los efectos tóxicos han sido registrados en la mayoría de los casos a niveles de glifosato y / o exposiciones GBH[10],[15] muy por encima de la dosis ultra-baja se administra a los animales en esta investigación. Así, es difícil atribuir definitivamente uno o más mecanismos de toxicidad observados en estos niveles de dosis superiores a las patologías hepáticas y renales observados en nuestro estudio. No obstante, nuestra observación de una importante acumulación de snoRNAs tanto en hígado y los riñones del grupo tratado con Roundup (Fig. 3, Tabla 2) admite la posibilidad de daños derivados de estrés oxidativo ya que se sabe que desempeñan un papel crítico en la amplificación de los efectos de las especies reactivas del oxígeno y la oxidación aguas abajo lesión tisular mediada por el estrés [30]. El estudio de Michel y sus colegas demostró la inducción de la expresión snoRNA como un vínculo funcional entre el progreso de la muerte celular lipotoxic y la respuesta celular al estrés oxidativo nocivo [30].Lipotoxicidad se manifiesta como estrés oxidativo mejorada y como la señalización proinflamatoria elevada, a menudo se asocia con la acción anormal de insulina [31]. Es de destacar que hemos encontrado alteraciones en las vías asociadas con estos procesos biológicos en nuestro estudio (Fig.5).
Además, el análisis de las vías reveló alteraciones en la modulación de la mTOR y sistemas de señalización fosfatidilinositol, ambos vinculados a la regulación de la síntesis de lípidos entre otras funciones celulares importantes [32]. Fosfoinositida 3-quinasa transduce señales procedentes de diversos factores en mensajes intracelulares por fosfolípidos de generación, la interrupción de los cuales es uno de los principales procesos de punto final de toxicidad observados en el hígado y los riñones en este estudio (Fig. 5). En general, estos resultados sugieren una implicación del estrés lipotoxic asociada con el estrés oxidativo y la señalización proinflamatoria elevada, que es una característica de hígado crónica y la enfermedad renal [33].
Condiciones lipotóxico crónicas en nuestro estudio también se ven corroboradas por el análisis que muestra aumento de los niveles de triglicéridos séricos bioquímicos [17]. En algunas circunstancias, el exceso de ácidos grasos libres inducen la muerte celular apoptótica [33].Nuestro análisis también indica cambios en las vías intracelulares subyacentes posiblemente un cambio en el crecimiento celular, tales como el péptido C de la proinsulina vía de señalización, así como la mTOR y la fosfatidilinositol sistemas de señalización. Homeostasis tisular depende de un delicado equilibrio entre la apoptosis y proliferación celular. Cuando el estrés oxidativo provoca apoptosis, las células dañadas son reemplazadas generalmente a través de aumento de la proliferación. Curiosamente, resultados similares han sido recientemente reportado donde el análisis del transcriptoma de la trucha marrónexpuestos a glifosato o Roundup a una concentración (10 μg / L) se encuentran típicamente en el medio ambiente, reveló una sobre representación de vías involucradas en el estrés oxidativo, apoptosis, y el regulación de la proliferación celular[34]. Sin embargo, aunque hay evidencia para sugerir que el glifosato puede inhibir múltiples funciones celulares tales como la respiración mitocondrial, y actividades enzimáticas distintas de EPSPS dentro de la vía de shikimato, la existencia de tales mecanismos directos de interferencia a la dosis ambiental bajo prueba aquí Actualmente sigue siendo desconocida y por lo tanto necesita una mayor exploración.
El desequilibrio de proliferación / apoptosis también puede haber sido ya sea causado o promovida por una interrupción crónica del sistema endocrino y la activación o represión de las vías de señalización. La activación de fosfoinosítido 3-quinasa (PI3K) por las hormonas tales como estrógenos[35] resulta en una regulación a la baja mundial de los genes que codifican los miembros del ciclo de Krebs y la fosforilación oxidativa, la mitocondria defectuosa, y la reducción de la respiración [36]. Las hormonas y sus receptores nucleares tienen interacciones dinámicas con los complejos de remodelación de la cromatina y la función spliceosome [37]. Como hemos observado una perturbación en estrógenos / testosterona equilibrio y disfunción pituitaria en los animales estudiados aquí [17], una relación entre los patrones de expresión de genes alterados y patologías a través de un mecanismo perturbador endocrino es plausible, sobre todo porque endocrinos efectos perturbadores pueden ocurrir a dosis muy bajas [38]. Además, las mejores puntuaciones redes factor de transcripción que pueden explicar las alteraciones asociadas al Roundup observados en la expresión génica que se presenta aquí se centran en Creb1, ESR1, YY1, c-Myc y Oct3 / 4 (Fig. 4), que cooperan para regular la expresión génica después de la estimulación hormonal [39]. El desequilibrio hormonal se asocia generalmente con insuficiencia renal o hepática [40]. Además, el glifosato se ha encontrado para actuar como un agonista de estrógenos en ensayos de células de cáncer mamario humano estimular el crecimiento en concentraciones comparables a la hormona nativa [13], [41]. Este potencial estrogénico del glifosato puede haber contribuido a la tendencia en el aumento de la incidencia de tumores mamarios en las ratas tratadas con Roundup analizado en esta investigación [17].
Una consideración importante es que el Roundup no es un solo compuesto, sino una mezcla de un ingrediente activo (glifosato) en combinación con diversos adyuvantes, que son necesarios para estabilizar y permitir la penetración del glifosato en las plantas. En exposiciones agudas a corto plazo, algunos adyuvantes pueden ser considerados como responsables de la toxicidad de Roundup [42].Sin embargo, como la composición adyuvante es propietario y no totalmente descrita, no es posible atribuir la toxicidad de la formulación total herbicida agrícola para un componente dado. Así, los resultados de nuestro estudio no son directamente comparables con otras pruebas glifosato solo. Los resultados que presentamos pueden ser específicos para la formulación estudiada, ya que la toxicidad de diferentes adyuvantes GBH puede variar en un factor de al menos 100 basado en ensayos que implican un 24 h de exposición a las células de cultivo de tejidos humanos [42]. Los estudios futuros que implican la administración de glifosato solo sería arrojar luz sobre esta cuestión.
En resumen, se detectaron las alteraciones en el perfil del transcriptoma muy por debajo del glifosato IDA (0,3 mg / kg de peso corporal / día) establecido en la Unión Europea, y se encuentra dentro del rango admitido en el agua potable (0,1 ppb) y productos alimenticios (por ejemplo, 20 ppm en soja GM o 2 ppm en los riñones de la especie bovina). Como disruptor endocrino probable, GBH / glifosato puede alterar el funcionamiento de los sistemas hormonales y perfiles de expresión génica a través de diferentes mecanismos, dependiendo de la dosis. Futuros estudios metabolómicos y proteómicos de estos órganos podrían proporcionar una mayor comprensión mecanicista en el proceso patológico mediado por Roundup observado.


Conclusiones

Se sabía con anterioridad que el consumo de glifosato en agua por encima de los límites autorizados puede provocar insuficiencia renal y problemas reproductivos [43]. Los resultados del estudio presentado aquí indican que el consumo de niveles mucho más bajos de una formulación GBH, a concentraciones de glifosato equivalente admisibles, se asocian con alteraciones a gran escala del transcriptoma hígado y el riñón que se correlacionan con los signos observados de anatomorphological hepática y renal y cambios patológicos bioquímicos en estos órganos [17].Además, como la dosis de Roundup se determinó que es relevante para el medio ambiente en términos de humano [4], animales domesticados[12] y la vida silvestre [34], [44] los niveles de exposición, nuestros resultados tienen implicaciones potencialmente importantes para la salud de las poblaciones animales y humanas. Además, los datos también sugieren que los nuevos estudios que incorporan principios de pruebas de endocrinología y de desarrollo epigenética, en particular, para evaluar la endocrina capacidad disruptiva de GBH / glifosato, se debe realizar para investigar las posibles consecuencias de la exposición a dosis bajas durante la vida temprana, así como en los adultos.


Conflicto de intereses

Los autores declaran que no tienen intereses en conflicto.


Autores de las contribuciones

RM realizó el análisis estadístico, interpreta los datos transcriptoma, y ​​redactó el manuscrito. MA llevó a cabo el experimento transcriptoma y ayudó con la interpretación de los datos. CM y MM realizan e interpretan el análisis de microscopía electrónica. GES concibió la prueba de alimentación de los animales y proporciona tejidos para su análisis. MNA y GES concibe el estudio. MNA coordinó la investigación y redactó el manuscrito. Todos los autores leyeron y aprobaron el manuscrito final.


Archivos adicionales

Archivo adicional 1 :. Metadatos. Metadatos de las muestras de hígado y riñón utilizados para el análisis de microarrays incluyendo la edad de las ratas en el momento de la muerte a través de la eutanasia. (XLSX 10 kb)
Formato: XLSX Tamaño: 11KB Descargar archivo 

Archivo adicional 2 :. Análisis PCA no revela una correlación entre las alteraciones en el perfil del transcriptoma y la edad en el momento de la muerte. Los grupos de 5 ratas de control y categorías de tratamiento Roundup fueron generados de manera que 5 animales con un tiempo antes de la muerte (esferas amarillas) se compararon con 5 que fueron sacrificados en un último punto de tiempo (esferas de color púrpura) en un análisis de PCA. No se observaron diferencias significativas en los perfiles de expresión de racimo transcripción sobre esta base con muestras de principios y puntos de tiempo de muerte siendo este último entremezclados. Por ejemplo, para el hígado, el perfil de transcripción expresión grupo de 10 ratas con un punto de tiempo antes de la muerte (609 +/- 125 días) tomado de los controles (5 ratas) y Roundup grupos (5 ratas) en comparación con los 10 animales con este último la muerte tratada (727 +/- 11 días) tuvieron un q-valor de 0,99. (DOCX 42 kb)
Formato: DOCX Tamaño: 42KB Descargar archivo 
La disposición 3 :. Video del análisis PCA muestra una clara separación en grupos de tratados (rojo) y el control (verde) ratas en muestras de hígado. (WMV 1131 kb)
Formato: WMV Tamaño: 1.1MB Descargar archivo 

Archivo adicional 4 :. Video del análisis PCA muestra una clara separación en grupos de tratados (rojo) y el control (verde) ratas en muestras de riñón. (WMV 1246 kb)
Formato: WMV Tamaño: 1,2 MB Descargar archivo 

La disposición 5 :. . Perturbaciones racimo transcripción Común en el hígado y los riñones de las ratas que recibieron 0,1 ppb Roundup en el agua potable ID es el número de identificación de Affymetrix grupo transcripción, FC indica el cambio veces (grupos de transcripción upregulated resaltados en rojo; grupos de transcripción downregulated resaltan en verde), P es el p-valor (a dos caras t-test) y q la tasa de falso descubrimiento (calculado por el método de Benjamini-Hochberg). Las diferencias más significativas (p <0 class="apple-converted-space" corte="" de="" destacan="" en="" generaron="" gris="" los="" se="" span="" valores="" y=""> de p <0 el="" fc="" y=""> 1.1 utilizando Qlucore ómicas Explorer 3.0. Los genes con el cambio veces en la expresión> 2 se resaltan en amarillo. (DOCX 180 kb)

Formato: DOCX Tamaño: 180KB Descargar archivo

La disposición 6 :. Datos de microarrays es confirmada por análisis de RT-qPCR. Un total de 18 genes fueron seleccionados al azar entre los grupos de transcripción 1319 cuya expresión es comúnmente hasta downregulated-o en el hígado y riñones como se muestra por análisis de microarrays, fueron elegidos para la validación por RT-qPCR. Los datos del análisis de microarrays se representa en barras grises y que a partir de la RT-qPCR en barras negras. El RT-qPCR se realizó mediante un ensayo TaqMan por cuadruplicado y contrastado en 4 genes de referencia (Gapdh, HPRT1, ACTB y Pes1). Dos colas de Student t-test se realizó comparando el grupo tratado con Roundup a sus respectivos controles (* p <0 class="apple-converted-space" span=""> p <0 class="apple-converted-space" span=""> 
p <0 span="" style="background: #C9D7F1;">El patrón general de la RT-qPCR confirmó los resultados del análisis de microarrays. (DOCX 38 kb)
Formato: DOCX Tamaño: 38KB Descargar archivo 

Archivo adicional 7 :. Redes de factores de transcripción asociados con la alteración de la transcripción de los genes alterados comúnmente en el hígado y los riñones. La lista de los grupos de transcripción comúnmente perturbados en el hígado y los riñones se utiliza para la generación de redes que utilizan el algoritmo regulación de la transcripción con la configuración predeterminada con MetaCore. (TIFF 4891 kb)
Formato: TIFF Tamaño: 4.8MB Descargar archivo 

Agradecimientos

Este trabajo fue financiado por la Alianza Sustentable de Alimentos (EE.UU.), cuyo apoyo se agradece.


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Fuente: http://www.ehjournal.net

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